Dear All

I would like to invite you to the next Nencki Institute Seminar which will take place on the 20^th of October, as usual at 3pm in the CN hall.

We will host dr. Paweł Dłodko, who is leading the Dioscuri Centre in Topological Data Analysis at the Mathematical Institute of Polish Academy of Sciences in Warsaw. Pawel will give a lecture entitled: Shapes in biology – how mathematics helps to quantify information about structure of data.

Abstract:

Mathematics, while mostly dealing with numbers, can also quantify other important concepts: shapes. In this talk I will provide a short introduction to the tools of topological data analysis and show how they can be used to analyze biological data. We will start by presenting various topological descriptors of embedded trees and use them to classify shapes and function of neuronal cells.,Then we will move to descriptors of porosity of bones and show how they can help in quantifying various diseases, for instance osteoporosis, based on clinical CT, micro-CT and synchrotrone based data. We will then move to abstract descriptors of histological images and models of multi-dimensional micro-array-based data. When discussing those applications I will describe the main idea of the tools that, hopeful, you can find useful in your work.

Short bio:

Paweł has graduated from computational mathematics at Jagiellonian University in 2012. Subsequently he worked as a researcher in the University of Pennsylvania, Inria Saclay and Swansea University. Paweł established his Dioscuri Centre in 2020. Paweł’s main interest is to provide mathematically rigorous tools for researchers in other sciences. He and his group are actively developing new and efficient topological methods to analyze various aspects of the shape of data.

See more on:
https://dioscuri-tda.org/members/pawel.html
https://twitter.com/DioscuriTda
https://www.facebook.com/Dioscuri.Centre.TDA
https://www.youtube.com/channel/UC125Yn2MSsxr0B05zLDQtsQ

The seminar will be followed by a get together reception.

Best regards
Aleksandra Pękowska

Projekty upowszechniania nauki: „Biologia bez tajemnic – największe odkrycia z dziedziny biologii”, przygotowany przez Zespół d.s. Popularyzacji Nauki w Instytucie Nenckiego oraz „Tydzień mózgu przez cały rok – 2022”, zaproponowany przez Fundację Wspierania Nauk Biologicznych im. Marcelego Nenckiego, otrzymały finansowanie w ramach programu Ministerstwa Edukacji i Nauki – Społeczna Odpowiedzialność Nauki.

W ramach projektu „Biologia bez tajemnic – największe odkrycia z dziedziny biologii” zaplanowano lekcje dla dzieci i młodzieży oraz serię kolejnych podcastów „Scientifreak” (https://www.youtube.com/c/NenckiEduTube). Zorganizowane zostaną również dwa Sympozja dla Nauczycieli Biologii.

Celem projektu „Tydzień mózgu przez cały rok – 2022” jest upowszechnianie wiedzy o mózgu i układzie nerwowym, oraz zwrócenie uwagi opinii publicznej na zagadnienia związane z prawidłowym i patologicznym jego funkcjonowaniem.

Wydarzenia „Tygodnia Mózgu przez cały rok” będą udostępniane na stronie Fundacji i Instytutu Nenckiego https://nenckifoundation.eu/, jak też w mediach społecznościowych: https://www.facebook.com/FundacjaNenckiego

Serdecznie zapraszamy do udziału w tych wydarzeniach!

19 października 2022 r. o godz. 11:00 w Instytucie Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN (sala im. Jerzego Konorskiego na II piętrze) odbędzie się publiczna obrona rozprawy doktorskiej na stopień doktora nauk ścisłych i przyrodniczych w dyscyplinie nauki biologiczne mgr Gabrieli Olech-Kochańczyk pt. „Wpływ białka i ciałek jądrowych PML na morfologię jądra komórkowego neuronów oraz funkcje kognitywne myszy”

Promotor: dr hab. Witold Konopka
Promotor pomocniczy: dr Adriana Magalska

Recenzenci: prof. dr hab. Marek Maleszewski, prof. dr hab. Elżbieta Pyza, dr hab. Dariusz Smoliński, prof. UMK

Link do streszczenia i recenzji: https://cloud.nencki.gov.pl/d/ec64793f94/

26 października 2022 r. o godz. 13:00 w Instytucie Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN (sala im. Jerzego Konorskiego na II piętrze) odbędzie się publiczna obrona rozprawy doktorskiej na stopień doktora nauk ścisłych i przyrodniczych w dyscyplinie nauki biologiczne mgr Svitlany Antoniuk pt. “Neural Correlates of Emotional Contagion in Humans: Familiarity Between Participants Does Not Enhance Transmission of Fear”

Promotorzy: prof. dr hab. Jakub Włodarczyk, prof. Evgeni Ponimaskin
Recenzenci: Prof. Dr. Philippe Marin, Dr hab. Agata Faron-Górecka, Dr. Adrian Newman-Tancredi

Link do streszczenia i recenzji: https://cloud.nencki.gov.pl/d/a661a6190e/

4 listopada 2022 r. o godz. 12:00 w Instytucie Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN (sala im. Jerzego Konorskiego na II piętrze) odbędzie się publiczna obrona rozprawy doktorskiej na stopień doktora nauk ścisłych i przyrodniczych w dyscyplinie nauki biologiczne mgr Anny Krysiak pt. „Rola czynnika odpowiedzi na surowicę – SRF w procesie dojrzewania kolców dendrytycznych”

Promotor: dr hab. Katarzyna Kalita-Bykowska, prof. Instytutu Nenckiego PAN
Recenzenci: dr hab. Jan Rodriguez-Parkitna, prof. Instytutu; dr hab. Paweł Niewiadomski

Link do streszczenia i recenzji: https://cloud.nencki.gov.pl/d/9f4e49a7df/

9 listopada 2022 r. o godz. 12:00 w Instytucie Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN (sala im. Jerzego Konorskiego na II piętrze) odbędzie się publiczna obrona rozprawy doktorskiej na stopień doktora nauk ścisłych i przyrodniczych w dyscyplinie nauki biologiczne mgr Moniki Prill pt. „Wpływ indukowanej stresem oksydacyjnym aktywacji ścieżki sygnalizacyjnej białka p66Shc na mitochondrialne parametry bioenergetyczne i poziom reaktywnych form tlenu w ludzkich liniach raka sutka MDA-MB-231 oraz MCF-7”

Promotor: prof. dr hab. Mariusz Więckowski
Recenzenci: prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz; prof. dr hab. Marek Tchórzewski

Link do streszczenia i recenzji: https://cloud.nencki.gov.pl/d/4037aea07a/

Dear Colleagues,

we would like to cordially invite you to the upcoming Brain Imaging Meeting organized by Laboratory of Brain Imaging (LOBI) and Laboratory of Language Neurobiology (LLN).

The seminar will take place on Wednesday 19.10.2022 at 3:00 PM, at the Neurobiology Center (the first floor) or online under the link bellow.

During the meeting Anna Kaźmierowska will presents a talk entitled: „Fear contagion in human-human and human-rat dyads involves the basolateral and centromedial amygdala”

Abstract

Fear contagion is an automatic, unconscious process of aligning emotional distress of one animal to that of the other. Considering its important evolutionary role, we hypothesized it to be a cross-species phenomenon that would involve the amygdala. We thus investigated the social transfer of fear between humans and rats. The habituated rats were handled by familiar humans who underwent the fear conditioning task and following the interaction, the rats’ amygdalae activations were analyzed using the c-Fos expression. Additionally, we used functional magnetic resonance imaging to investigate the activations in the amygdalar nuclei during fear contagion between human subjects. The rat amygdala was activated to a higher extent in experimental compared to control rats. A significant change in activation was observed in both basolateral and centromedial nuclei, as compared to the average activations from the control group. The amygdala activation was also present in human data, and was also significantly increased in both basolateral and centromedial nuclei when compared to the baseline hemodynamic response. These results are the first to demonstrate that the same amygdalar subparts are activated in both human-human and human-rat fear contagion. This suggests that the common system of emotional communication may exist in both humans and rats.

Join Zoom Meeting
https://zoom.us/j/96997359225?pwd=VzBrRlZzcFZUSUR3ZjUyZE5CaDUxQT09

Meeting ID: 969 9735 9225
Passcode: 127811
One tap mobile
+48223065342,,96997359225#,,,,*127811# Poland
+48223073488,,96997359225#,,,,*127811# Poland

Dial by your location
+48 22 306 5342 Poland
+48 22 307 3488 Poland
+48 22 398 7356 Poland
Meeting ID: 969 9735 9225
Passcode: 127811
Find your local number: https://zoom.us/u/aKjrlcdcj

See you there!
Brain Imaging Meeting Team
https://lobi.nencki.gov.pl/meetings/