Prof. Adam Szewczyk – Prezesem Polskiego Towarzystwa Biochemicznego.

W dniu 27 kwietnia 2022 roku w czasie Zgromadzenia Sprawozdawczo-Wyborczego Polskiego Towarzystwa Biochemicznego wybrano nowe władze Towarzystwa na lata 2022-2025. Prezesem Towarzystwa wybrano prof. dr hab. Adama Szewczyka.

Prof. Adam Szewczyk był wieloletnim Sekretarzem oraz wice-Prezesem Polskiego Towarzystwa Biochemicznego. W latach 2006-2014 uczestniczył w pracach Komitetu Wykonawczego Federacji Europejskich Towarzystw Biochemicznych (FEBS). Był współorganizatorem Kongresów FEBS, które odbywały się w Warszawie (2004) oraz Krakowie (2019). Prof. Adam Szewczyk był wieloletnim dyrektorem a obecnie jest Przewodniczącym Rady Naukowej Instytutu Biologii Doświadczalnej PAN im. M. Nenckiego. Prowadzi badania w obszarze bioenergetyki molekularnej dotyczące mitochondrialnych kanałów jonowych.

Nencki Institute Seminar

Dear All

it is my pleasure to invite you to the next Nencki Institute Seminar on Thursday May 12th at 3 pm, in the CN lecture hall. We will host dr Salvatore Spicuglia, head of the Functional genomics of normal and leukemic T cells team at the TAGC (Theories and Approaches of Genomic Complexity) in Marseilles.

Dr. Spicuglia will give a lecture entitled: Dissection of cis-regulatory elements with dual promoter and enhancer function: From high-throughput approaches to mechanistic insights


Gene expression is controlled by the involvement of gene-proximal (promoters) and distal (enhancers) regulatory elements. Our previous results have demonstrated that a subset of gene promoters, termed Epromoters, works as bona fide enhancers and regulates distal gene expression. Here, we hypothesized that Epromoters play a key role in the coordination of rapid gene induction during the inflammatory response. Using a high-throughput reporter assay we explored the function of Epromoters in response to type I interferon. We found that clusters of IFNa-induced genes are frequently associated with Epromoters and that these regulatory elements preferentially recruit the STAT1/2 and IRF transcription factors and distally regulate the activation of interferon-response genes. Based on these findings, we developed a bioinformatic pipeline to predict Epromoter-like regulated clusters. Using this pipeline, we identified and validated the involvement of Epromoter-containing clusters in the regulation of several inflammatory and stress responses. Our findings suggest that Epromoters function as a local hub recruiting the key TFs required for coordinated regulation of a subset of gene clusters during the inflammatory and stress responses.

We also cordially invite you to the get together reception which will follow dr Spicuglia’s talk.

Best regards

Aleksandra Pękowska

Seminarium Doktorantów

Szanowni Państwo,

Serdecznie zapraszamy na Seminarium Doktorantów, które odbędzie się 13 maja 2022 roku o godz. 10.30 w Sali Konferencyjnej CN (I piętro). W programie przewidzianych jest 6 prezentacji:

  1. Patrycja Dzianok
  2. Jakub Wojciechowski
  3. Maria Kulesza

Przerwa (5-10 min)

  1. Ewa Bączyńska
  2. Karolina Nizińska-Smolińska
  3. Paulina Pilanc-Kudlek

Informacje dotyczące prelegentów wraz z abstraktami znajdują się poniżej.

Seminarium odbywać się będzie w trybie hybrydowym. Link do spotkania:


Z pozdrowieniami,

Anna Filipek & Anna Nowicka

Patrycja Dzianok

Laboratory of Emotions Neurobiology

Supervisor: Dr hab. Ewa Kublik

Auxiliary promoter: Dr Katarzyna Jurewicz

Title: Genetic variations in the APOE and PICALM Alzheimer’s disease risk-genes may be associated with health and cognitive functions in non-demented healthy adults


Alzheimer disease (AD) is the most common dementia causing global medical and social burden. Faster and more reliable diagnostic tests are needed just as much as effective therapies. AD results from a complex interplay of genetic, environmental and lifestyle factors. To understand this interplay, and find early biomarkers predicting cognitive decline, we must combine genomics within depth phenotyping of patients and non-symptomatic carriers of AD risk-genes.

For that reason, we invited healthy, middle-aged participants and collected a vast database with demographic, psychological, and genetic data (APOE/PICALM) along with medical blood tests and neuroimaging (high-density EEG and fMRI) data from resting state, attention related task (MSIT+) and memory related task (Sternberg).

Our current results show multiple differences between the groups carrying different genetic burdens, indicating that AD risk genes influence cognitive functions, psychosocial functioning, and health markers already in middle-aged healthy individuals. Further longitudinal studies are needed to confirm the observed associations.

Jakub Wojciechowski
Laboratory of Emotions Neurobiology
Supervisor I: Dr hab. Mateusz Gola
Supervisor II: Dr hab. Ewa Kublik

Title: Appetitive Conditioning and Extinction in CSBD Patients – fMRI study

The prevalence of problematic pornography use (PPU) in both adults and adolescents is increasing however there in no consensus whether it is strictly compulsive or addictive behavior. The latest ICD-11 finally included PPU under Compulsive Sexual Behavior Disorder (CSBD) unit, however the conditioning process in those patients seems to be altered, similar to addiction. Our study focused on the Ventral Striatum (VS) and Amygdala, which are part of the reward system, and their functional magnetic resonance (fMRI) activation during appetitive instrumental
conditioning and extinction in tasks with both erotic and monetary rewards.
Age-matched CSBD patients and healthy control subjects (n=32 in each group) participated in the study. In addition to measuring fMRI brain activity and reaction times in tasks, subjects also rated their arousal and valence toward cues before and after conditioning.
Preliminary results suggest that conditioning process is indeed altered in CSBD patients on both behavioral and functional level, although in a puzzling way. Supported by NCN Grant  2016/21/N/HS6/02635.

Maria Kulesza

Laboratory of Brain Imaging

Supervisor: Dr hab. Artur Marchewka, prof. IBD

Auxiliary promoter: Dr Marek Wypych

Title: Neural processing of emotionally charged autobiographical memories in women with major depressive disorder and borderline personality disorder

Our past experiences and knowledge about ourselves are stored in autobiographical memory (AM). Due to their emotional and sensory details, we are able to recall and relieve them. Previous studies showed a network of brain regions involved in AM recall in healthy populations, such as the limbic system, prefrontal, and occipital cortices.
AM recall may be disturbed in several clinical disorders, such as depression (MDD) or borderline personality disorder (BPD), where patients have difficulties with emotion regulation and processing the self. Some studies showed that patients recall fewer details and tend to recall more negative experiences.
Here, I compared the neural processing of sad (SM) and happy memories (HM) in women with MDD, BPD, and healthy control (HC) who were asked to recall and rate the memories during an fMRI session. Subjective emotional state after AMs was less positive in the BPD group than in HC. Moreover, within the MDD and HC groups, SMs were less vivid than HMs.
The main effect of recall showed robust activations across the AM recall network. The main effect of emotion revealed greater activations within this network in SMs. Functional connectivity analysis revealed increased connectivity between the left amygdala and right parietal operculum for SMs in the MDD group when compared to BPD. This could indicate that amygdala plays a different role in depression than in BPD.

Break  (5-10 min)

Ewa Bączyńska

Laboratory of Cell Biophysics

Supervisor: Prof. dr hab. Jakub Włodarczyk

Auxiliary promoter: Dr Monika Bijata

Title: Role of the 5-HT7 receptor in the development of depressive-like behavior


Depression is a global medical problem frequently leading to suicides. It is assumed that depressive symptoms occur as a result of aberrant excitatory synaptic plasticity developed after chronic stress. Recently discovered a new 5-HT7 serotonin receptor-dependent signaling pathway leads to aberrant structural and functional synaptic plasticity in the hippocampal neurons in vitro. It was shown that reactivity of the 5-HT7 serotonin receptor (5-HT7R) is strongly regulated by stress hormones, and possibly may underlie depressive symptoms. Using a combination of behavioral, biochemical, and imaging methods, we verified whether the 5-HT7R is involved in the development of depressive-like behavior. Our results showed that activation of the 5-HT7R leads to the development of depressive-like behavior in mice and that the 5-HT7R-dependent signaling pathway is specifically activated in the hippocampus of anhedonic animals and associated with the structural remodeling of dendritic spines. The stress-resilient animals after chronic stress did not display the aforementioned alterations. Our results indicate the 5-HT7R crucial role in the development of depressive phenotype and reveal an alternative direction for drug discovery in which mechanisms will promote stress resilience.

Karolina Nizińska-Smolińska

Laboratory of Epileptogenesis

Supervisor: Prof. dr hab. Katarzyna Łukasiuk

Title:  The role of Methyl-CpG binding domain 3 (MBD3) in epileptogenesis


Epilepsy is a neurological disorder induced by a pathophysiologic process that is not fully understood. 30% of epilepsies are evoked by an insult to the brain which is followed by a latency period (epileptogenesis) before the appearance of spontaneous seizures. During epileptogenesis and epilepsy, several molecular and cellular changes occur, including alterations in gene and protein expression. MBD3 protein is a reader of DNA methylation marks that play an important role in epileptogenesis.

To determine changes in MBD3 protein level in the rat brain after seizure, we used rat model of acute seizure evoked by intraperitoneal injection of pentylenetetrazol (PTZ). Changes in Mbd3 expression and MBD3 protein level were examined in the hippocampus, entorhinal and somatosensory cortex. We observed an increased level of MBD3 protein in the entorhinal cortex 4h after PTZ injection.

In the next part we decided to test the hypothesis that modification of Mbd3 expression affects acute seizures. AAV viruses to increase (AAV-SYN-MBD3-GFP) and decrease (AAV-sh(MBD3)-GFP) Mbd3 expression were injected bilaterally (0,4µl) to the basolateral amygdala (BLA). Behavioral tests were performed 2 weeks after injection. Next, we performed PTZ test with EEG recording. Our results showed the reduction of MBD3 prolonged latency time to evoke acute seizure.

Paulina Pilanc-Kudlek

Laboratory of Molecular Neurobiology

Supervisor: Prof. dr hab. Bożena Kamińska-Kaczmarek

Auxiliary promoter: Dr Aleksandra Ellert-Miklaszewska

Title: Reprogramming of myeloid cells in the microenvironment of gliomas as a new therapeutic strategy          


Glioblastoma (GBM) is the most common and aggressive brain cancer, for which the current therapies are not effective and most tumors recur within few months. Immunotherapy using immune checkpoint inhibitors (CPI) aims to restore antitumor immune response. However, GBM patients respond poorly to immunotherapies as GBM is immunologically a “cold” tumor with low infiltration of functional T and natural killer (NK) cells. We aim to develop new strategies to reactivate antitumor immune responses in GBM and sensitize this tumor to CPI. These strategies infer targeting glioma-associated brain-resident microglia and recruited peripheral myeloid cells (GAMs), which contribute to the immunosuppressive tumor microenvironment (TME). Using a mouse glioma model, we applied two approaches: i) blocking the activity of arginase 1 (Arg1) with OAT-1746- a novel, potent and selective small molecule inhibitor, and ii) interfering with a protumoral action of glioma-derived osteopontin (Spp1) using a short integrin-blocking peptide. Expression of Arg1 is a defining feature of immunosuppressive GAMs and leads to depletion of L-arginine, a nutrient required for T cells and NK cells proliferation, while activation of integrin receptors by glioma-derived Spp1 is one of factors responsible for the protumorigenic switch of GAMs. Tumor growth was evaluated using MRI and immunosorting of GAMs combined with RNAseq transcriptomic profiling and multiparametric flow cytometry analysis allowed for characterization of immune infiltrates in the glioma TME. In both proposed strategies, targeting immunosuppressive GAMs as an adjuvant to CPI led to augmented antitumor activity that was due to boosting of both innate and adaptive immune responses.

Obrona Rozprawy Doktorskiej

31 maja 2022 r. o godz. 13:00 odbędzie się on-line publiczna obrona rozprawy doktorskiej na stopień doktora nauk ścisłych i przyrodniczych w dyscyplinie nauki biologiczne mgr. Juliana Swatlera pt. „Role of leukemic extracellular vesicles in differentiation and suppressive activity of regulatory T cells”

Promotor: dr hab. Katarzyna Piwocka, prof. Instytutu Nenckiego PAN
Promotor pomocniczy: dr Ewa Kozłowska
Recenzenci: dr hab. n. med. Małgorzata Firczuk, prof. dr hab. Piotr Trzonkowski, prof. dr hab. Ewa Zuba-Surma

Link do obrony:  https://zoom.us/j/96378283870?pwd=MVVoekxjMkhaNHVvOUJ6dzdVbmZPQT09

Link do streszczenia i recenzji: https://cloud.nencki.gov.pl/d/17c082a249/

Masz zaproszenie na webinar Zoom.
Kiedy: 31 maj 2022 01:00 PM Warszawa
Temat: Obrona pracy doktorskiej mgr Juliana Swatlera

Kliknij poniższy link, aby dołączyć do webinaru: https://zoom.us/j/96378283870?pwd=MVVoekxjMkhaNHVvOUJ6dzdVbmZPQT09

Kod dostępu: 432670

Lub wystarczy jedno stuknięcie na urządzeniu mobilnym: Polska: +48223987356,,96378283870#,,,,*432670# lub +48223065342,,96378283870#,,,,*432670#

Połączenie telefoniczne:
Wybierz numer (uby uzyskać lepszą jakość, wybierz numer zgodny z Twoją bieżącą lokalizacją):
Polska: +48 22 398 7356 lub +48 22 306 5342 lub +48 22 307 3488
Identyfikator webinaru: 963 7828 3870
Kod dostępu: 432670
Dostępne numery międzynarodowe: https://zoom.us/u/abIK5HU51

Rekrutacja doktorantów do Instytutu Nenckiego PAN

Instytut Nenckiego PAN ogłasza rekrutację do Warszawskiej Szkoły Doktorskiej Nauk Ścisłych i Biomedycznych Warsaw-4-PhD na rok akademicki 2022/2023.

– możliwość uzyskania stopnia doktora w jednym z największych nieuniwersyteckich ośrodków w dyscyplinie nauk biologicznych w ramach multidyscyplinarnej szkoły doktorskiej Warsaw-4-PhD,
– możliwość zdobycia wiedzy oraz rozwoju naukowego pod kierunkiem najwybitniejszych naukowców,
– udział w interesujących projektach naukowych,
– prowadzenie badań w nowoczesnych laboratoriach,
– przyjazne środowisko w międzynarodowej społeczności doktorantów,
– stypendia dla wszystkich doktorantów,
– udział w konferencjach i stażach zagranicznych,
– prywatną opiekę medyczną

Zapisz się on-line: https://warsaw4phd.eu/
Rekrutacja trwa od 21 maja 2022 r. do 04 czerwca 2022 r.

Zaproszenie do udziału w Konferencji Brain Tumors 2022

W imieniu Komitetu Organizacyjnego mamy ogromną przyjemność zaprosić Państwa do udziału w konferencji „Brain Tumors 2022 – From Biology to Therapy” – międzynarodowego spotkania naukowców i klinicystów specjalizujących się w dziedzinie neuroonkologii. Konferencja odbędzie się w dn. 22-24. czerwca 2022 r. w Centrum Neurobiologii Instytutu Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN w Warszawie. Program konferencji obejmuje wykłady ponad 25 wybitnych uczonych z Europy, Izraela i Stanów Zjednoczonych. Więcej informacji znajdziecie Państwo na naszej stronie internetowej www.braintumorswarsaw.pl, stronie na portalu Facebook (BrainTumorsWarsawPL) i na naszym Twitterze (@BTWarsaw). Do zobaczenia w Warszawie!

Instytut Nenckiego na targach PSBI EXPO 2022

Instytut Nenckiego, jako członek Porozumienia Akademickich Centrów Transferu Technologii (PACTT), zaprasza w dniach 18-19 maja 2022r. na targi „PACTT Science Business Innovation EXPO 2022” (PSBI EXPO 2022). Organizatorami targów są Politechnika Łódzka, PACTT oraz Ministerstwo Edukacji i Nauki.

PSBI EXPO 2022 to wydarzenie skierowane do przedsiębiorców, w ramach którego jednostki naukowe i badawcze zaprezentują ofertę swoich technologii oraz wysokospecjalistycznych usług. Ponadto dzięki udziałowi funduszy inwestycyjnych, istnieje możliwość zapoznania się z ofertą finansowania wdrożeń technologii do przemysłu. Gośćmi targów będą również partnerzy biznesowi, którzy prowadzą trwałą współpracę z uczelniami, i którzy w ramach dyskusji panelowych podzielą się swoim doświadczeniem w obszarze prowadzenia działalności badawczo-rozwojowej w Polsce oraz rozwoju produktów i marki we współpracy ze światem nauki.

Instytut Nenckiego jako jeden z wystawców, serdecznie zaprasza naszych Partnerów oraz wszystkich zainteresowanych do zapoznania się z ofertą innowacyjnych rozwiązań:

Pret2DSensor – wczesne wykrywanie insulinooporności i stanu przedcukrzycowego w cukrzycy typu 2
Koniugaty peptyd-nośnik jako potencjalny lek w chorobie Alzheimera
Panel biomarkerów miRNA we krwi w diagnostyce choroby Alzheimera 
Ifenprodil w leczeniu chronicznych drgawek
Innowacyjna terapia glejaka

oraz bogatego panelu usług z zakresu:

analiz bioinformatycznych,
analiz cytometrycznych
badań behawioralnych
mikroskopii elektronowej
mikroskopii optycznej
sekwencjonowania nowej generacji (NGS)
prowadzenia badań przedklinicznych
obrazowania struktur mózgu

Ofertę zaprezentujemy bardziej szczegółowo na targach.

Do zobaczenia w Łodzi!