1 stycznia 2020r. rozpoczęliśmy w Instytucie Nenckiego realizację Projektu NEBI – Krajowy Ośrodek Badań Obrazowych w Naukach Biologicznych i Biomedycznych, uzyskanego w ramach Programu Operacyjnego Inteligentny Rozwój.

Celem projektu jest utworzenie Krajowego Centrum Zaawansowanych Analiz Obrazowania w Naukach Biologicznych i Biomedycznych – zaawansowanej infrastruktury informatycznej do gromadzenia i przetwarzania danych oraz stworzenie supernowoczesnej zintegrowanej platformy do wielowymiarowego obrazowania procesów biologicznych, warunkujących zarówno prawidłowe funkcjonowanie organizmu, jak i leżących u podłoża chorób cywilizacyjnych.

Aby umożliwić realizację Projektu, w 2021r., na terenie Stacji Badawczej Instytutu Nenckiego w Mikołajkach, powstanie nowoczesny, dwukondygnacyjny budynek naukowo-badawczy, w którym zlokalizowane będzie m. in. Laboratorium Modelowania i Wizualizacji Dynamiki Złożonych Procesów Biologicznych, serwerownia, pomieszczenia zaplecza IT i telekomunikacji. Dodatkowo w jednym z budynków zlokalizowanych na terenie Stacji Badawczej Instytutu Nenckiego PAN w Mikołajkach zostaną utworzone Laboratorium Obrazowania Biologicznego i Biomedycznego za Pomocą Technik Wysokoprzepustowych oraz Laboratorium Obrazowania Struktur i Funkcji Komórek i Tkanek za Pomocą Technik Wysokorozdzielczych. Dzięki opracowaniu i wdrożeniu rozwiązań pozwalających na kontrolowany i współdzielony dostęp do generowanych danych, dostępna dla licznych użytkowników platforma online pozwoli na pełne wsparcie zdalnego procesu projektowania oraz zaawansowanej wizualnej analizy i przetwarzania danych pochodzących z wysokorozdzielczych mikroskopów, wysokoprzepustowej aparatury badawczej oraz eksperymentów obliczeniowych.

28 maja 2020r, w Instytucie Nenckiego podpisana została umowa na wykonanie projektu architektoniczno-budowlanego, z wybraną w ramach konkursu firmą architektoniczną. Z przyjemnością prezentujemy wizualizację nowego budynku Krajowego Centrum Zaawansowanych Analiz Obrazowania Biologicznego i Biomedycznego.

Dear All,

It is my great pleasure to invite you to our next Institute’s seminar which will take place the next Thursday, the 25^th of June. Dr. Cecilia L. Winata, who is a Group Leader at the International Institute of Molecular and Cell Biology in Warsaw, will give a lecture entitled

„Constructing the gene regulatory network underlying heart development using genomics”

Abstract

Organogenesis involves dynamic regulation of gene transcription and multi-pathway interactions. Heart development is an example of such complex process which, when disrupted, results in congenital heart defect. Despite our knowledge of key factors regulating various steps of heart morphogenesis, considerable challenges in understanding its mechanism still exist as little is known about their downstream targets and interactive regulatory network. Cardiac pacemaker cells are set apart from cardiomyocytes early in the course of heart development through the initiation of distinct molecular programs. To understand the nature of interaction between transcription factors and epigenomic landscape and how it translates into the resulting diversity of cardiac cell identity, we profiled the transcriptome and chromatin states of cardiomyocytes and cells of the sinoatrial ring and atrioventricular canal which were FACS-isolated from zebrafish transgenic lines expressing EGFP in respective populations. Analyses of cardiomyocytes revealed major gene expression changes and chromatin rearrangement throughout different stages of heart morphogenesis and identified genetic regulatory hubs driving key events of heart development. Furthermore, loss of function of cardiac transcription factors Gata5, Tbx5a, and Hand2 affected these regulatory networks and caused global changes in chromatin accessibility profile. Comparative analyses between cardiomyocytes and pacemaker transcriptomes revealed distinct molecular profiles which will provide insights into the mechanism of their diversification.

Please use this meeting ID: meet.google.com/eeh-stxq-ojc

Please also make sure you mute your microphones during the talk.

Best regards,
Aleksandra Pekowska